في إطار حرص المجلس منذ إنشائه على تضمين أجندة عمله على موضوعات تتعلق بقضايا منع انتشار الأسلحة النووية، ونزع السلاح النووي بصفة عامة، حيث لا تخلو الأنشطة السنوية للمجلس حول قضايا السياسة الخارجية من ندوة أو ورشة عمل أوغيرها من الفعاليات الخاصة بهذه الموضوعات، عُقد المؤتمر المشترك الثاني بين جامعة الدول العربية، والمنتدى العربي النووي برئاسة المجلس المصري للشؤون الخارجية تحت شعار “الانعكاسات الأمنية الإقليمية للاتفاق النووي الإيراني مع مجموعة دول (5+1)”، وذلك بمقر الأمانة العامة للجامعة يومي 28 و29 فبراير 2016.

وانطلاقًا من اهتمام المجلس ببلورة المخرجات الفكرية لمعظم الأنشطة التي يقوم بها في صورة مطبوعات وإصدارات تحوي ما جاء في هذه الفعاليات من رؤى وأفكار حول معظم القضايا والمسائل ذات الاهتمام على الصعيد المحلي والإقليمي والدولي، فقد تم رصد وقائع جلسات هذا المؤتمر وإصدارها في كُتيب، تركزت محاور التناول فيه على القضايا الرئيسية التي طرحت في المؤتمر، ومن أهمها:

• تحديات الأمن القومي العربي، من مفهوم الأمن القومي العربي (نظرة إقليمية) ومكافحة الإرهاب في المنطقة العربية.

• الاتفاق النووي الإيراني مع مجموعة دول (5+1)، حيث ناقش المؤتمر دور الوكالة الدولية للطاقة الذرية في متابعة تنفيذ الاتفاق ورؤية تحليلية له.

• الانعكاسات الأمنية للاتفاق النووي الإيراني مع مجموعة الـ(5+1)، حيث نوقشت الانعكاسات على الأمن القومي العربي، وعلى أمن دول الخليج العربي، وفرص إخلاء منطقة الشرق الأوسط من الأسلحة النووية.

• آثار الاتفاق النووي الإيراني على الاستخدامات السلمية للطاقة النووية، من حيث الأمن والأمان النووي، وعرض لتجارب عربية لبرنامج نووي سلمي، وذلك بجانب تحليل لمضمون حقوق والتزامات الدول الأطراف في الاتفاق النووي الإيراني وطبيعته القانونية وآثاره الإقليمية، وانعكاساته على نظام عدم الانتشار في منطقة الشرق الأوسط بصفة خاصة، والاستخدامات السلمية للطاقة النووية.

• مستقبل الشراكة العربية النووية والاستراتيجية العربية النووية حتى عام 2020، والتحضيرات لعقد مؤتمر المراجعة لعام 2020 في ظل عدم التوصل لعالمية معاهدة عدم انتشار الأسلحة النووية.